Cynhyrchion

Astudiwyd topoleg bilen parth sianel colicin E1 gan drosglwyddo egni cyseiniant fflworoleuedd (FRET).Roedd y FRET yn cynnwys asid amino fflwroleuol (coumarin) wedi'i amgodio'n enetig fel y rhoddwr a gweddillion cystein wedi'i labelu'n ddetholus wedi'i glymu â DABMI (4-(dimethylamino)phenylazophenyl-4'-maleimide) fel derbynnydd FRET.Ymgorfforwyd y gweddillion coumarin fflwroleuol yn y protein trwy bâr synthetase tRNA/aminoacyl-tRNA orthogonal a oedd yn caniatáu ymgorffori dethol i unrhyw safle o fewn parth sianel colicin.Roedd pob amrywiad yn cynnwys treiglad stop (TAG) ar gyfer ymgorffori coumarin a threiglad cystein (TGT) ar gyfer atodiad DABMI.Pennwyd chwe phellter rhynghelaidd o fewn helis 1-6 gan ddefnyddio dadansoddiad FRET ar gyfer y cyflyrau hydawdd a philen-rwym.Roedd data FRET yn dangos newidiadau mawr yn y pellteroedd rhynghelaidd rhwng helices 3-6 ar gysylltiad pilen gan roi mewnwelediad newydd i strwythur rhwymo bilen parth y sianel.Yn gyffredinol, gostyngodd yr effeithlonrwydd rhynghelaidd coumarin-DABMI FRET ar rwymo pilen, gan adeiladu ar y model ymbarél ar gyfer y sianel colicin.Datblygwyd model petrus ar gyfer cyflwr caeedig parth y sianel yn seiliedig ar ddata FRET cyfredol a data a gyhoeddwyd yn flaenorol.Mae'r model yn awgrymu trefniant cylchol o helices 1-7 i gyfeiriad clocwedd o'r ochr allgellog a'r cysylltiad rhyngwynebol pilen o helices 1, 6, 7, a 10 o amgylch y pin gwallt trawsbilen canolog a ffurfiwyd gan helices 8 a 9.