Cynhyrchion

Rydym wedi adrodd yn ddiweddar bod niwcleotid pyrene yn cael ei fewnosod yn ffafriol gyferbyn â safle sylfaenol, y 3'-T o dimer thymin, a'r rhan fwyaf o fasau heb eu difrodi gan burum DNA polymerase eta (pol eta).Gan fod pyrene yn foleciwl amnpolar heb unrhyw allu bondio H, mae effeithlonrwydd anarferol o uchel mewnosod dPMP yn cael ei briodoli i'w allu uwch i bentyrru sylfaen, ac yn tanlinellu pwysigrwydd pentyrru sylfaen wrth ddewis niwcleotidau gan pol eta.Er mwyn ymchwilio i rôl bondio H a geometreg pâr sylfaen wrth ddewis niwcleotidau gan pol eta, gwnaethom bennu effeithlonrwydd mewnosod y niwcleotidau sylfaen-addasu 2,6-diaminopurin, 2-aminopurine, 6-cloropurine, ac inosin a fyddai'n gwnewch nifer wahanol o fondiau H gyda'r sylfaen templed yn dibynnu ar geometreg pâr sylfaen.Mae'n ymddangos bod paru sylfaen Watson-Crick yn chwarae rhan bwysig wrth ddewis analogau niwcleotid i'w gosod gyferbyn â C a T fel y dangosir gan y gostyngiad yn yr effeithlonrwydd mewnosod cymharol gyda gostyngiad yn nifer bondiau H Watson-Crick a chynnydd mewn nifer y rhyngweithiadau rhoddwr-rhoddwr a derbynnydd-derbynnydd.Mae detholusrwydd mewnosodiad niwcleotid yn fwy gyferbyn â'r 5'-T na 3'-T y dimer thymin, yn unol â gwaith blaenorol sy'n awgrymu bod y 5'-T yn cael ei ddal yn fwy caeth na'r 3'-T.Ar ben hynny, mae'n ymddangos bod mewnosod A gyferbyn â dwy T y dimer yn cael ei gyfryngu gan baru sylfaen Watson-Crick ac nid gan baru sylfaen Hoogsteen yn seiliedig ar effeithlonrwydd mewnosod bron yn union yr un fath ag A a 7-deaza-A, ac nid oes gan yr olaf ohonynt H- gallu bondio yn N7.Mae'r effeithlonrwydd cymharol ar gyfer mewnosod niwcleotidau a all ffurfio sylfaen Watson-Crick yn parau'n gyfochrog â'r rhai ar gyfer darn Klenow, tra bod darn Klenow yn gwahaniaethu'n gryfach yn erbyn anghydweddu, yn unol â'i siâp mwy detholus.Mae'r canlyniadau hyn yn tanlinellu pwysigrwydd geometreg pâr sylfaen H-bondio a Watson-Crick wrth ddewis niwcleotidau gan pol eta a'r darn Klen ow, a rôl lai dethol siâp wrth fewnosod gan pol eta oherwydd ei fod yn fwy agored a llai. safle gweithredol cyfyngedig.